A pesquisa utilizou simulações envolvendo quatro doenças, cinco pragas e nove plantas daninhas, e avaliou três cenários de manejo: sem controle, controle parcial (40% de proteção) e controle ótimo (80% de proteção). Sob o controle ótimo, a produtividade por hectare pode atingir 72 sacas; com controle parcial, 52 sacas; e sem controle, 32 sacas, representando uma queda de 55% em relação ao máximo. Para compensar as perdas, seria necessário plantar 33,5 milhões de hectares adicionais. A perda média, em cenário sem manejo, seria de 121,3 milhões de toneladas, com um valor estimado de R$ 223,5 bilhões. O estudo também estima que a receita brasileira simulada com exportações de soja poderia chegar a US$ 44,2 bilhões com controle ótimo, reduzindo para US$ 26,6 bilhões sem controle, uma diferença potencial de US$ 17,6 bilhões por safra. A redução da oferta poderia gerar uma alta estimada no preço da soja de até 49%, o que, segundo o estudo, poderia elevar a inflação oficial em cerca de 0,26 ponto percentual, afetando preços de produtos como óleo, leite e ovos.
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